کلکسیون گیاهان زنده شامل دو زمین مزروعی

1. کلکسیون زعفران:

زعفران گیاهی است از تیره زنبقیان، سرده زعفران و جزء گران‌ترین ادویه های جهان است.  وجود دو ماده‌ی کروسین و سافرانال در زعفران به آن خاصیت دارویی می¬دهد لذا در صنایع پزشکی نیز از آن استفاده می¬کنند. زعفران به عنوان  یک محصول کشاورزی استراتژیک اهمیت بسزایی در اقتصاد کشاورزی ایران دارد.

در نتیجه ی فعالیت های ارزنده ی علمی بانک گیاهی این مرکز  کلکسیون بی نظیری از زعفران های ایران در قالب یک پروژه جامع که به منظور جمع آوری، شناسایی و ذخیره سازی گونه های مختلف این گیاه و خویشاوندان وحشی آن از نقاط مختلف ایران صورت گرفت، ایجاد شد.

2. کلکسیون آلیوم:

سیر، تره، والک یا پیاز  با نام علمی  Allium نام یک سرده از گیاهان است که دارای ۶۰۰ تا ۷۵۰ گونه است. در ایران در حدود ۷۰ گونه از آن موجود است. این جنس شامل گونه‌های مهم سبزیجات از قبیل پیاز، تره، و سیر بوده و بعضی از گونه‌های آن ارزش زینتی دارند. آلیوم های موجود در نقاط مختلف ایران در قالب طرحی بزرگ توسط همکاران بانک گیاهی مرکز ملی ذخائر ژنتیکی و زیستی ایران  جمع آوری شده و به شکل کلکسیون زنده در این مرکز موجود می باشد.