محاسبه شاخص(ANI (Average Nucleotide Identity پروکاریوت ها
محاسبه شاخص(ANI (Average Nucleotide Identity پروکاریوت ها (کد خدمت MG03)
شرایط ارسال نمونه: سکانس ژنومی assemble شده با کیفیت برای دو سویه مورد بررسی
شرح خدمت و هدف: شاخص ANI به طور گسترده برای مقایسه توالی های ژنومی دو سویه پروکاریوت جهت طبقه بندی و شناسایی آنها به کار می رود. بدین منظور لازم است توالی ژنومی کامل دو سویه پروکاریوتی ارسال شود تا ارزیابی دو به دو صحیح صورت گیرد.
روش کار: نمونه های ارسالی ابتدا از نظر کیفیت توالی ها مورد ارزیابی قرار میگیرند. بعد از تایید اولیه، توالی های دو نمونه با استفاده از الگوریتم های مورد تایید کمیته بین المللی سیستماتیک پروکاریوت ها، ارزیابی و نتیجه بررسی اعلام می گردد.
حیطه خدمت: تنها سکانس های معتبر سرهم بندی شده (Assembled) که مشخصاٌ مربوط به سویه های با قرابت ژنتیکی بالا هستند قابل ارزیابی با تکنیک مذکور می باشند.
جنبه های قانونی و حیطه تعهدات:
تنها سکانس های معتبر سرهم بندی شده (Assembled) کیفیت لازم برای بررسی با این روش را دارند. در غیر اینصورت مرکز مسئولیتی در قبال ارائه نتیجه مناسب بر عهده نمی گیرد.
نحوه ارسال جواب خدمت:
نتایج همراه با تائید و امضای مدیریت بانک و کارشناس مربوطه به صورت میزان شاخص ANI تحویل می گردد.