: شناسایی مولکولی سیانوباکترها : تعیین توالی نسبی ژن ۱۶S rRNA

نام خدمت : شناسایی مولکولی سیانوباکترها : تعیین توالی نسبی ژن 16S rRNA  

 کد خدمت MI14:

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

شرح خدمت و هدف آن

شناسایی مولکولی با استفاده از تعیین توالی ژن های حفاظت شده ریبوزومی یک روش مهم در بیوتکنولوژی و ژنتیک مولکولی است که برای شناسایی و دسته‌بندی میکروارگانیسم ها مورد استفاده قرار میگیرد. در این روش با تعیین توالی ژن 16S rRNA، که در تمام پروکاریوت ها وجود دارد، امکان تشخیص و مقایسه تنوع ژنتیکی بین آنها فراهم می‌شود. طول این قطعه 1500 جفت باز است که در این روش شناسایی حداکثر 1400 جفت باز از توالی کامل صورت میگیرد و به همین دلیل تحت نام شناسایی نسبی شناخته می شود. 

شرایط نمونه

نمونه ها باید تازه باشند و می توان به صورت کشت خطی در پلیت یا اسلنت در لوله فرستائه شوند، میزان آلودگی باکتریایی باید در کمترین حد باشد و بهتر است به صورت خالص باشد، لازم به ذکر می باشد که نمونه هایی که آلودگی بالایی دارند پذیرفته نمی شوند و باید ابتدا خالص سازی شوند. اطلاعات سویه اعم از نام سویه، نام محیط کشت، شرایط بهینه رشد و نیازمندی های خاص باید در فرم آورده شود، کشت سویه در آزمایشگاه انجام نمی شود مگر اینکه با مشتری هماهنگ شود پس خواهشمندایم اطلاعات به طور کامل در فرم آورده شود.

روش کار

این خدمت شامل فرآیند استخراج DNA، انجام PCR، تعیین توالی (حداکثر دو بار رفت و برگشت)، بررسی پیک های تحویلی و Blast سویه ها در پایگاه داده NCBI می باشد.

حیطه خدمت

شناسایی مولکولی نسبی در بانک میکروارگانیسم ها برای سویه های با ریسک گروپ 2 (بیماریزا)  و بالاتر قابل انجام نمی باشد. همچنین کلیه تست ها با استفاده از سوبستراهای رایج مورد بررسی برای شناسایی مولکولی انجام می شود.  

جنبه های قانونی و حیطه تعهدات خدمت

هر گونه اعتراض به نتایج فوق حداکثر تا  10 روز  پس از تاریخ صدور نتایج  قابل بررسی است.

نمونه های مشتریان تا 1 ماه پس از اعلام نتایج در بانک نگهداری می شوند و در صورت نیاز مشتری به تکرار آزمایشات بعد از این مدت ،  هیچ مسئولیتی متوجه بانک میکروارگانیسمها نمی باشد.

نتایج تست های فوق فقط در محدوده ذکر شده معتبر است و  تعیین توالی حداکثر دو بار رفت و برگشت صورت میگیرد، لذا در صورت عدم کیفیت مناسب سکانس ها بعد از دوبار خوانش مسئولیتی بر عهده مرکز نمی باشد و نیاز به انجام آزمایشات بیشتر و تکرار آنها، با صرف هزینه قابل انجام است.

 نحوه ارسال جواب خدمت

نتایج به صورت جدول ارزیابی کامل سکانس ها در پایگاه داده NCBI همراه با فایل های پیوست سکانس ها، نرم افزار Chromas pro و  رفرانس استخراج DNA به همراه نام و توالی پرایمرها ارائه می شود. توجه داشته باشید که در این روش تصویر ژل و زیر پروتکل استخراج یا PCR ارائه نمی شود.