تعیین توالی کل ژنوم (Whole Genome Sequencing)
تعیین توالی کل ژنوم (Whole Genome Sequencing) (کد خدمت MG06)
شرایط ارسال نمونه: پلیت کشت باکتری خالص و تازه (بیوماس می بایست به مقدار کافی روی پلیت ها جهت استخراج DNA موجود باشد)
شرح خدمت و هدف: تعیین توالی کل ژنوم فرآیندی است که طی آن توالی DNA ژنوم کل یک ارگانیسم در یک زمان مشخص می شود.
روش کار: در مرحله اول DNA سلولی از پلیت های کشت خالص باکتری، جداسازی و تخلیص می شود. سپس نمونه استخراج شده با روش Illumine sequencing تعیین توالی شده و قطعات حاصل از تعیین توالی سرهم بندی می شوند. در نهایت مطالعات بیوانفورماتیک و Annotation روی نمونه ها صورت می گیرد.
حیطه خدمت: در این روش امکان خوانش ژنوم کامل وجود ندارد و بخش هایی از ژنوم مطابق روش shotgun sequencing، Gap هایی در توالی باقی می مانند. البته ژنوم به دست آمده کاملا مناسب مطالعات ژنومی و مقایسه ای می باشد.
جنبه های قانونی و حیطه تعهدات:
تنها سویه های خالص و تازه امکان بررسی با این روش را دارند. در غیر اینصورت مرکز مسئولیتی در قبال ارائه نتیجه مناسب بر عهده نمی گیرد. مرکز مسئولیتی در قبال تحویل سکانس کامل ژنومی ندارد زیرا خوانش بدین شکل منوط به خواندن کلیه Gap های ژنومی است که در این روش Cover نمی شود.
نحوه ارسال جواب خدمت:
نتایج همراه با تائید و امضای مدیریت بانک و کارشناس مربوطه به صورت فایل توالی های سر هم بندی شده و نتایج Annotation تحویل می گردد.
قیمت: بر اساس تعداد و قیمت ارز متغیر است