محاسبه شاخص GGDC ((Genome -to -Genome Distance Calculator پروکاریوت ها
محاسبه شاخص GGDC ((Genome -to -Genome Distance Calculator پروکاریوت ها (کد خدمت MG05)
شرایط ارسال نمونه: سکانس ژنومی سر هم بندی شده(assemble) با کیفیت برای حداقل دو سویه مورد بررسی
شرح خدمت و هدف: شاخص GGDC یک سرویس بر پایه وب است که قرابت DNA سویه های پروکاریوتی را براساس تعریف جهانی و دقیق از گونه/زیر گونه های پروکاریوتی بدون به وجود آمدن مشکلات ناشی از DDH کلاسیک ارائه می نماید.
روش کار: نمونه های ارسالی ابتدا از نظر کیفیت توالی ها مورد ارزیابی قرار میگیرند. بعد از تایید اولیه، توالی های با استفاده از الگوریتم های مورد تایید کمیته بین المللی سیستماتیک پروکاریوت ها، ارزیابی و نتیجه بررسی اعلام می گردد.
حیطه خدمت: تنها سکانس های معتبر سرهم بندی شده (Assembled) که مشخصاٌ مربوط به سویه های با قرابت ژنتیکی بالا هستند قابل ارزیابی با تکنیک مذکور می باشند.
جنبه های قانونی و حیطه تعهدات:
تنها سکانس های معتبر سرهم بندی شده (Assembled) کیفیت لازم برای بررسی با این روش را دارند. در غیر اینصورت مرکز مسئولیتی در قبال ارائه نتیجه مناسب بر عهده نمی گیرد.
نحوه ارسال جواب خدمت:
نتایج همراه با تائید و امضای مدیریت بانک و کارشناس مربوطه به صورت معیار تشابه مولکول ها تحویل می گردد